防衛総司令部（ぼうえいそうしれいぶ）とは、太平洋戦争時に内地・朝鮮・台湾に在る軍隊を広域防衛（防空のこと）の見地から、一元指揮するために設けられた大日本帝国陸軍の組織。通称・略称は防総。
沿革 1941年（昭和16年）7月5日、軍令陸甲第33号を以って編成された。大元帥たる天皇に直隷していることから総軍の格とされ、便宜上「防衛総軍」と表記される例もあるが実際は総軍ではなく、作戦部隊・隷下部隊を持たず、東部軍・中部軍・西部軍・北部軍・朝鮮軍・台湾軍などの司令部を防空の見地から指揮する組織である。
その後、1944年（昭和19年）からは指揮のみでなく統率もするものとし、1945年（昭和20年）4月、本土決戦（決号作戦）を睨み津軽海峡以南の日本内地のみを管轄区域として第1総軍・第2総軍に分割・改編し完全な統率機関とした。
総司令部人事 総司令官 山田乙三大将（教育総監との兼職）：昭和16年（1941年）7月7日 - 昭和16年12月9日 東久邇宮稔彦王大将（兼軍事参議官）：昭和16年（1941年）12月9日 - 昭和20年4月8日（廃止） 総参謀長 河辺虎四郎少将：昭和16年（1941年）7月31日 - 昭和16年（1941年）12月1日 小林浅三郎中将：昭和16年（1941年）12月1日 - 昭和18年（1943年）6月10日 佐野忠義中将：昭和18年（1943年）6月10日 - 昭和19年（1944年）3月28日 小林浅三郎中将：昭和19年（1944年）3月28日 - 昭和20年（1945年）2月1日 須藤栄之助中将：昭和20年（1945年）2月1日 - 昭和20年（1945年）4月8日（廃止） 総参謀副長 白銀重二少将：昭和19年（1944年）2月7日 - 昭和20年（1945年）2月1日 後藤光蔵少将（兼第2方面軍参謀副長）：昭和20年（1945年）2月1日 - 昭和20年（1945年）4月8日（廃止）
指揮下にあった部隊 防衛軍 部隊東部軍留守近衛師団留守第2師団留守第51師団留守第52師団第61独立歩兵団東部軍砲兵隊東部防空旅団東京湾要塞中部軍留守第3師団留守第4師団留守第53師団留守第54師団第63独立歩兵団第64独立歩兵団中部防空旅団舞鶴要塞由良要塞
防衛軍 部隊西部軍留守第5師団留守第6師団留守第55師団留守第56師団第66独立歩兵団西部軍砲兵隊西部防空旅団下関要塞対馬要塞長崎要塞壱岐要塞奄美大島要塞中城湾要塞船浮要塞豊予要塞
軍 部隊北部軍第7師団留守第57師団樺太混成旅団第67独立歩兵団北千島要塞宗谷要塞津軽要塞朝鮮軍第19師団留守第20師団羅津要塞鎮海湾要塞永興湾要塞麗水要塞釜山要塞台湾軍留守第48師団基隆要塞高雄要塞第8飛行師団