thumb|オオコウモリの骨格
コウモリは、哺乳類翼手目（よくしゅもく、Chiroptera、コウモリ目田隅本生 「哺乳類の日本語分類群名，特に目名の取扱いについて 文部省の“目安”にどう対応するか」『哺乳類科学』第40巻 1号、日本哺乳類学会、2000年、83 - 99頁。）に属する構成種の総称である。世界各地に約1000種から1400種が棲息する『動物園を100倍楽しむ！飼育員が教えるどうぶつのディープな話』、2023年7月10日発行、大渕希郷、株式会社緑書房、P117。「夕空の群れ、コウモリの多様性」ナショナル ジオグラフィック（2014年10月31日）2022年1月1日閲覧。この数は、世界中の哺乳類の種の割合として、齧歯目の約40％につぐ、約20％を占める。
日本語における漢字表記としては蝙蝠こうもりの数え方は？NHK放送文化研究所（2022年1月1日閲覧）、仙鼠三省堂編修所 『三省堂 難読漢字辞典』 三省堂 2009 p22、按状翼三省堂編修所 『三省堂 難読漢字辞典』 三省堂 2009 p154がある。別名に天鼠（てんそ）、飛鼠（ひそ）がある。
特徴 世界で一番小さなコウモリは、キティブタバナコウモリで体長約3㎝程度であり、哺乳類の中でも測定によっては最小ともされる。
世界最大の種はクロオオコウモリで、翼を広げると翼幅が180センチメートルとなる。ギネス記録によると、フィリピンオオコウモリやなどが挙げられているLargest bat ギネス記録。
翼、手足 翼手類は翼をもち、完全な飛行ができる動物である。前肢が翼として飛行に特化する形に進化しており、多くの鳥類と同様、はばたくことによって飛行するが、コウモリの翼は鳥類の翼と大きく構造が異なっている。鳥類の翼は羽毛によって包まれているが、コウモリの翼はと呼ばれる伸縮性のある膜でできている。この細かな毛が生えた翼の表面には触覚受容器（メルケル細胞）が存在し、気流を感知して飛行をサポートする。
哺乳類では、他にもムササビ、モモンガ、ヒヨケザルなどの飛膜を広げて滑空する種が知られているが、鳥類に匹敵するほどの完全な飛行能力を有するのは翼手目のみである。 コウモリは目の前の獲物だけでなく、次の獲物の位置も先読みしながら最適なルートを飛んでいる。
オヒキコウモリの水平飛行速度の最速記録は時速160キロである。
コウモリの前肢（前足）は、親指が普通の指の形で鉤爪があることを除けば、全て細長く伸びている。飛膜はその人差し指以降の指の間から、後肢（後ろ足）の足首までを結んでいる。腕と指を伸ばせば翼となって広がり、腕を曲げればこれを折りたたむことができる。さらに後ろ足と尾の間にも飛膜を持つものも多い。また、鳥と異なり、後ろ足は弱く、立つことができない。休息時は後ろ足でぶら下がる。前足の親指は爪があって、排泄時など、この指でぶら下がることもできる。
多くのコウモリは、頭が下に来るようにぶら下がるが、6種のみ頭が上の状態でタビビトノキの葉などにぶら下がる。頭を上にする種のは手首や足首の裏に特殊な汗を分泌して表面張力を利用して、穴の開いた壁面にもぶら下がれるようになっている。この汗の効果が知られる前は、足のを利用するものと考えられていたため、英語名に吸盤を表す Sucker が付いていた。
ニュージーランドに生息するや南アメリカなどに生息するナミチスイコウモリの2種は、地上を機敏に移動できることができる。また、化石となった古代のコウモリにツギホコウモリと同様に地面から飛び立つことを可能にする特殊な筋肉組織を支えるひじの構造があり、古代のコウモリも地上で機敏に移動して、素早く飛び立つ能力があったことを示唆している。
モモジロコウモリに砂を掘ってねぐらとする行動が見られる。
渡りの記録 鳥と同じように、コウモリも渡りを行う。最長記録は、2017年にラトビアからスペインまでの2224キロメートルを飛んだがあったが、2022年には同種によるロシアからフランスアルプスまで、2486キロメートルの記録が確認された。
ドローンやレーダーを用いた追跡などが行われてきたが、2020年代頃になると小型の無線発信機が付けられるようになり、数日間で1000キロメートル以上も移動する能力を持つことや、渡りのタイミングや経路などの詳細が判明しだした。
超音波と鳴き声 ココウモリ類は超音波を用いた反響定位を行うことでよく知られている。種によって異なるが、主に30kHzから100kHzの高周波を出し、その精度はかなり高く、ウオクイコウモリのように微細な水面の振動を感知し、水中の魚を捕らえるものまでいる。コウモリの存在する地域における夜行性の昆虫やカエルなどは反響定位対策となる器官や習性を持つものも多い。ただし、大型のオオコウモリの仲間は反響定位を行わない種が多い。
コウモリの共通祖先が飛行能力を獲得したあと、3つの系統に分かれ、そのうちの2つの系統で反響定位能力をそれぞれが収斂進化的に独自に獲得したと見られている。
感覚器 地磁気を感知する体内内蔵型の磁気コンパス（磁覚）を持ち帰巣能力を制御する。
また、吸血コウモリは哺乳類としては珍しく赤外線を感知する能力を持ち、温血動物の体の高温部分を知ることができる。
体温調整 体が小さいことから、熱の影響が大きく、食事によるエネルギーも変動するため変温性であり、体力を維持するために休眠状態や冬眠を利用する。体温が熱くなると、呼吸数を増やし、翼を広げて表面積を広げ扇いだり、翼に唾液をつけるを行う。
食性 一般にコウモリといえば西洋では吸血鬼につながるイメージがあるが、動物の血液を常食とする他の動物の血を吸う種（チスイコウモリ）は既知の種で3種のみで、鋭い切歯で傷をつけて出てきた血を舐めとる形式である。たいていのコウモリは虫などの小動物や果実を中心とした植物を食べる。また、吸血性のコウモリは柔らかい果実食あるいは果汁食から進化したものと見られている。コウモリ類の多くは、下顎はを保持しているものの、上顎は派生した双波歯型となっている。さらに詳しくみると、 昆虫食、果実食、花蜜・花粉食、下等脊椎動物食、魚食、肉食、血液食などに適応した臼歯の変化も見られる。
熱帯においては、花の蜜や花粉を食べる種があるため、それに対する適応として花粉の媒介をコウモリに期待する、コウモリ媒の花がある。
寿命 哺乳類は一般に大型のものほど長命であるが、コウモリ類は身体の大きさの割に非常に長生きで、体重20gから30gにすぎないキクガシラコウモリが20年以上生きた例もある。これは、空を飛べて夜行性であるために天敵が少なく死亡率が低いこと、空を飛ぶという制約から高い繁殖力を持てず（ほぼすべての種で、１回の繁殖期でもうける子供は1頭だけである）、充分な数の子孫を残すには長命になるしかなかったことなどが考えられる。コウモリはこうした長命を保つために特殊な代謝をしていることがうかがわれ、休眠時は呼吸や心拍数が極端に下がり一種の仮死状態となる。鳥類でも同様の代謝を持つ進化を遂げた動物としてハチドリなどがいる。
進化
恐竜の栄えた中生代において、飛行する脊椎動物の主流は恐竜に系統的に近い翼竜と恐竜の直系子孫である鳥類が占めていた。中生代の終結において、恐竜とともに翼竜は絶滅し、鳥類も現生の鳥類に繋がる新鳥類以外の系統が絶えた。これにより、飛行する脊椎動物という生態系ニッチには幾分か「空き」ができた。ここに進出する形で哺乳類から進化したのがコウモリ類である。コウモリが飛行動物となった時点では、鳥類は既に確固とした生態系での地位を得ていたため、コウモリはその隙間を埋めるような形での生活圏を得た。
コウモリの直系の祖先にあたる動物や、コウモリが飛行能力を獲得する進化の途上過程を示す化石は未だに発見されていない。おそらく彼らは樹上生活をする小さな哺乳類であり、前肢に飛膜を発達させることで、樹上間を飛び移るなど、活動範囲を広げていき、最終的に飛行能力を得たと思われる。確認される最古かつ原始的なコウモリはアメリカ合衆国ワイオミング州で化石が産出したオニコニクテリスで、始新世初期（約5200万年前）の地層から発見されている。この時期には既に前肢は（現生群に比べ短いなどの原始的特徴が目立つものの）翼となっており、飛行が可能になっていたことは明白である。化石から耳の構造を詳細に研究した結果、反響定位を持っていなかったことが判明し、コウモリはまず飛行能力を得たのちに、反響定位を行う能力を得たことが分かっている。
分布
翼手目は南極大陸以外の全大陸に分布し、さらに海洋島にも広く分布する。このような例は人為分布を除いては哺乳類の中では他にない。これは、哺乳類が（クジラ類などの例外を除けば）陸上動物であり、しかも大きく進化したのが大陸移動による各大陸の分裂後であったため、陸橋などの存在如何でその分布が大きく制限されているのに対し、翼手目は鳥類同様に翼による飛翔能力を持ち、海などによって遮られた場所でも自由に移動できたためであると考えられている。 たとえば、ハワイ諸島において、在来の陸上哺乳類はアカコウモリ属の1種のみだった。
分類 位置づけ
古代ローマの博物学者であるプリニウスは、コウモリのことを「翼持つネズミ」と呼び、鳥類に分類していた。江戸時代、小野蘭山の『本草綱目啓蒙』でも、「かはほり」（コウモリ）はムササビと共に鳥類に分類されている。
近代分類学では哺乳類に分類されたが、その始祖と言うべきカール・フォン・リンネは、主にオオコウモリの形態からコウモリを霊長類に分類した中島宏章『ボクが逆さに生きる理由』（ナツメ社、2017年11月8日刊）73ページ。その見解が否定されて後も、霊長目（サル目）などと共に主獣類として分類されていた。
オオコウモリが霊長類に近いという説はその後もあり、1986年「ココウモリとオオコウモリでは、脳と視神経の接続の仕方がまったく異なり、オオコウモリのそれは霊長目および皮翼目（ヒヨケザル目）と同一で、他の哺乳類には見られない独特のものである」ことを主な根拠に、「ココウモリはトガリネズミ目から進化し、オオコウモリはそれより後に霊長目から進化した」という、コウモリ類2系統説が提唱されたPettigrew J.D.,"Flying primates? Megabats have the advanced pathway from eye to midbrain",Sceience,231,pp 1304-1306,(1986)。
しかし、1990年代からの分子系統の研究により、翼手目はやはり単系統で、食肉目（ネコ目）、偶蹄目、奇蹄目（ウマ目）、鱗甲目（センザンコウ目）などと共に、ローラシア獣上目の系統に属することが明らかになった。なお、主獣類は多系統だったもののコウモリを除けば単系統であり、真主獣類として現在も認められている。
2006年、東京工業大学のグループによる研究（レトロポゾンの挿入の分析）によって、翼手目はローラシア獣類の中でも奇蹄目や食肉目、鱗甲目に近縁であるという説が提唱された。奇蹄目のウマと翼を持つコウモリが含まれることから、ギリシャ神話の有翼馬であるペーガソス (, ) にちなんだペガサス野獣類 () がこの系統の名称として提案された。
しかしその後の複数の分子系統解析から、翼手目は真無盲腸目の姉妹群である類の中の最初の分岐群であることがわかっており、（有蹄類（偶蹄目+奇蹄目）+広獣類（食肉目+鱗甲目））と姉妹群である。
オオコウモリとココウモリ 伝統的に、翼手目は大翼手亜目（オオコウモリ亜目 Megachiroptera、オオコウモリ類）と小翼手亜目（コウモリ亜目 Microchiroptera、ココウモリ類）に分けられてきた。
オオコウモリはその名のとおり大型のコウモリの仲間で、オオコウモリ科の1科のみが属する。中には翼を広げた幅が2mに達する種もある。よく発達した視覚によって、植物性の食物を探す。果実を好み、農業従事者からは害獣として扱われる場合もある。オオコウモリのほとんどの種は反響定位を行わない。
ココウモリは小型のコウモリの仲間で、17科が属し、多くの種に分かれている。多くが食虫性であるが、植物食、肉食、血液食など様々な食性の種がいる。コウモリ亜目の特徴は、反響定位をすることである。超音波を発し、その反響を検知することで、飛行中に障害物を避けたり、獲物である昆虫などを見つけたりすることができる。
オオコウモリとココウモリには翼を持つという共通点があるが、それを除けばあまりにも多くの違いがあるため、上記の通り「別々の祖先から進化し、独立に飛行能力を獲得したのではないか」という説もあった。しかし、最近のミトコンドリアDNA配列の解析により、オオコウモリとココウモリは系統的にも近縁であることが明らかになっており、どちらも飛行能力を初めて獲得した共通の祖先から進化したものと考えられている。
1997年のマッケンナとベルによる分類体系では、小翼手亜目の下に陽翼手下目Yangochiropteraと陰翼手下目Yinochiropteraの2グループが置かれていた。2001年に分子系統によって、小翼手亜目は側系統であり、小翼手亜目の一部はオオコウモリ科に近縁であることがわかった。その系統に基づき、翼手目を亜目（新たな陽翼手類）と亜目（新たな陰翼手類）に分類しなおすことが提案された。これによる新たな陽翼手類はココウモリの一部（旧陽翼手下目）、新たな陰翼手類はココウモリの残り（旧陰翼手下目）とオオコウモリ科を含むものである。VespertilioniformesとPteropodiformesも同様のコンセプトによる分類群であり、より簡潔した分類名として提案されているJames M. Hutcheon and John A. W. Kirsch (2006), "A moveable face: deconstructing the Microchiroptera and a new classification of extant bats," Acta Chiropterologica 8(1), 1-10.。
科と主な種
以下は上述の新しい分類に基づくものである。現生の上科・科についてはBurgin et al. (2020) に従ったConnor J. Burgin, Jane Widness & Nathan S. Upham, “Introduction,” In: Connor J. Burgin, Don E. Wilson, Russell A. Mittermeier, Anthony B. Rylands, Thomas E. Lacher & Wes Sechrest (eds.), Illustrated Checklist of the Mammals of the World, Volume 1, Lynx Edicions, 2020, Pages 23-40.。 †オニコニクテリス科 （†は絶滅） †アルカイオニクテリス科 インプテロキロプテラ亜目船越公威「第1章 分類と分布」「第10章 進化」『コウモリ学―適応と進化』東京大学出版会、2020年、1-21, 194-208頁。 / （和名なし）上科 オオコウモリ科 - 伝統分類ではこれのみ大翼手亜目、他は全て小翼手亜目 キクガシラコウモリ上科 - 狭義の陰翼手類冨田幸光『新版 絶滅哺乳類図鑑』伊藤丙雄・岡本泰子イラスト、丸善出版、2011年、160頁 アラコウモリ科 アラコウモリ - 全長7 - 9cm。東アフリカ、東南アジアに生息。 †グアムオオコウモリ（絶滅） ルーセットオオコウモリ - 全長約 25 cm。熟した果実や花の蜜、花粉などを食べる。夜は洞窟の中で休む。 インドオオコウモリ - 全長約 20.5 cm。インドに生息。 ハイガシラオオコウモリ（） ロドリゲスオオコウモリ（） #日本のコウモリも参照。 オナガコウモリ科 カグラコウモリ科 #日本のコウモリ参照。 キクガシラコウモリ科 #日本のコウモリ参照。 ブタバナコウモリ科 （和名なし）科 オレンジカグラコウモリ属 ヤンゴキロプテラ亜目 / - 陽翼手類 サシオコウモリ上科 サシオコウモリ科 ミゾコウモリ科 サラモチコウモリ科 ウオクイコウモリ上科 ツギホコウモリ科 ウオクイコウモリ科 ウオクイコウモリ - 全長 12 - 15 cm。中南米に生息。 ツメナシコウモリ科 スイツキコウモリ科 クチビルコウモリ科 ヘラコウモリ科 チスイコウモリ - 全長 7.5 - 9 cm。中南米の平野部に生息。 シタナガヤリビヨウコウモリ - 全長 5.5 - 7.2 cm。中南米に生息。 ヒナコウモリ上科 アシナガコウモリ科 オヒキコウモリ科 #日本のコウモリ参照。 ユビナガコウモリ科 ユビナガコウモリ属 - ユビナガコウモリなど （和名なし）科 アンゴラホオヒゲコウモリ属 ヒナコウモリ科 #日本のコウモリ参照。
系統 以下の系統樹はHao et al. (2024)による。
日本のコウモリ thumb|245px|right|アブラコウモリ 日本では、移入種を除く約100種の哺乳類のうち、約3分の1に当たる35種（種数は分類説により若干変動する）をコウモリ類が占めており、約4分の1に当たる齧歯目24種を抑えて、最多の種数を擁している。また、近年は琉球列島の島々に固有種が発見されている。
このうち、オオコウモリ類は熱帯性で、日本では小笠原諸島と南西諸島にのみ分布する。
ただし、個々の種についてみれば、個体数が少ないと判定されているものもあり、多くの種がレッドデータブック（環境省版）入りとなっている。これには、日本ではコウモリの研究者が少なく、生息調査も散発的であるという事情もあるが、実際に絶滅の危険がある状態にあると考えられているものも多い。特に、森林性のコウモリについては、その生活の場である自然の広葉樹林と、それ以上に、住みかとなる樹洞ができるような巨木が極めて減少しており、棲息環境そのものが破壊されていることが、大きな問題となっている。コウモリ用の巣箱などが工夫されているが、普及していない。
洞窟に生活するもの（洞穴生物）は、集団越冬の場所などが天然記念物となっている場所もある。いずれにせよ、彼らの生活そのものも、未だに謎が多い。ユビナガコウモリなど、集団繁殖する種もある。これらのものでは、季節的に大きな移動を行っている可能性が高いが、具体的な習性については、現在研究が進められつつある段階である。
日本在来種
オオコウモリ科 Pteropodidae オオコウモリ属 Pteropus クビワオオコウモリ P. dasymallus オキナワオオコウモリ P. loochoensis 【絶滅・固有種】 19世紀に 3 - 4 頭の採取記録。 オガサワラオオコウモリ P. pselaphon オヒキコウモリ科 Molossidae オヒキコウモリ属 Tadarida オヒキコウモリ T. insignis オヒキコウモリ T. i. insignis 日本最大の食虫性コウモリ。 スミイロオヒキコウモリ T. latouchei 2例のみ。オヒキコウモリの亜種とする説もある。 カグラコウモリ科 Hipposideridae カグラコウモリ属 Hipposideros カグラコウモリ（ヤエヤマカグラコウモリ） H. turpis ほぼ固有種だが、タイ南部にも飛び地的に分布。 キクガシラコウモリ科 Rhinolophidae キクガシラコウモリ属 Rhinolophus キクガシラコウモリ R. ferrumequinum 日本に分布するものをニホンキクガシラコウモリ R. f. nippon という亜種とする場合もある。全長6.3-7.1cm。 コキクガシラコウモリ R. cornutus ニホンコキクガシラコウモリ R. c. cornutus オリイコキクガシラコウモリ R. c. orii オキナワコキクガシラコウモリ R. pumilus or R. p. pumilus 【固有種】 オキナワコキクガシラコウモリ R. p. pumilus 【固有種】 ミヤココキクガシラコウモリ R. p. miyakonis 【固有種】 ヤエヤマコキクガシラコウモリ R. perditus 【固有種】 石垣島・西表島。 ヤエヤマコキクガシラコウモリ（イシガキコキクガシラコウモリ） R. p. perditus 【固有種】 イリオモテコキクガシラコウモリ R. p. imaizumii ヒナコウモリ科 Vespertilionidae ホオヒゲコウモリ属 Myotis クロアカコウモリ M. formosus ツシマクロアカコウモリ M. f. tsuensis 【固有種】 モモジロコウモリ M. macrodactylus ドーベントンコウモリ M. daubentonii （日本個体群を含む東アジア産をM. petaxとする説もあり） ウスリドーベントンコウモリ（ウスリードーベントンホオヒゲコウモリ） M. d. ussuriensis ホオヒゲコウモリ M.mystacinus or M. gracilis ウスリホオヒゲコウモリ（ウスリーホオヒゲコウモリ） M. m. gracilis or M. gracilis クロホオヒゲコウモリ M. pruinosus 【固有種】 ヒメホオヒゲコウモリ M. ikonnikovi シナノホオヒゲコウモリ M. i. hosonoi ヒメホオヒゲコウモリ M. i. ikonnikovi エゾホオヒゲコウモリ M. i. yesoensis フジホオヒゲコウモリ M. i. fujiiensis オゼホオヒゲコウモリ M. i. ozensis カグヤコウモリ M. frater カグヤコウモリ M. f. kaguyae 【固有種】 ノレンコウモリ M. nattereri ホンドノレンコウモリ（ニホンノレンコウモリ） M. n. bombinus ヤンバルホオヒゲコウモリ M. yanbarensis 【固有種】1997年発見、1998年新種認定。 アブラコウモリ属 Pipistrellus アブラコウモリ（イエコウモリ） P. abramus 史前帰化動物。本種を日本固有種とし、アジア大陸に分布するものを P. javanicus という別種とする説もある。 モリアブラコウモリ P. endoi 【固有種】 オオアブラコウモリ P. savii 6例のみ。いずれも大陸からの迷行と思われる。 クロオオアブラコウモリ P. s. velox 4例のみ。大陸からの迷行と思われる。 コウライオオアブラコウモリ P. s. coreensis 2例のみ。大陸からの迷行と思われる。 オガサワラアブラコウモリ P. sturdeei 19世紀末に母島で採取された1例のみ。 クビワコウモリ属 Eptesicus ヒメホリカワコウモリ（キタクビワコウモリ） E. nilssonii ヒメホリカワコウモリ（キタクビワコウモリ） E. n. parvus クビワコウモリ E. japonensis 【／固有種】 ヤマコウモリ属 Nyctalus ヤマコウモリ（ニホンヤマコウモリ） N. aviator コヤマコウモリ N. furvus 4例のみ。ヨーロッパヤマコウモリ Nyctalus noctura と同一種とする場合もある。 ヒナコウモリ属 Vespertilio ヒナコウモリ V. superans ヒナコウモリ V. s. superans ヒメヒナコウモリ V. murinus チチブコウモリ属 Barbastella チチブコウモリ B. leucomelas チチブコウモリ B. l. darjilingensis ウサギコウモリ属 Plecotus ウサギコウモリ P. auritus 体長5-6cm、尾長約 5 cm。ユーラシア大陸北部（日本列島など）に生息する。日中は洞窟、大木の樹洞などに潜み、夜間は餌（昆虫など）を探して飛び回る。 ニホンウサギコウモリ P. sacrimontis 【固有種】 かつてはウサギコウモリの亜種 P. a. sacrimontis とされた。本種を独立種とする分類では、狭義のウサギコウモリP. auritusの分布はヨーロッパに限定され日本に分布しないことになる。 テングコウモリ属 Murina テングコウモリ M. leucogaster ニホンテングコウモリ M. l. hilgendorti リュウキュウテングコウモリ M. rykyuana 1997年に発見、1998年に新種認定。 コテングコウモリ M. ussuriensis ニホンコテングコウモリ M. u. silvatica クチバテングコウモリ M. tenebrosa 【固有種】1962年に対馬で発見、1970年に新種記載。標本は1点のみ。 ユビナガコウモリ科 Miniopteridae ユビナガコウモリ属 Miniopterus ユビナガコウモリ（アジアユビナガコウモリ） M. fuliginosus リュウキュウユビナガコウモリ（コユビナガコウモリ、オキナワユビナガコウモリ） M. fuscus かつては本州にも棲息していたと考えられる（1933年、紀伊半島での記録あり）。
文化
西洋においてコウモリは吸血鬼と結び付けられるが、そのイメージが定着したのはヨーロッパ人が新大陸に進出した以降の比較的新しい事象である。（吸血性のコウモリは中央アメリカから南アメリカにかけてのみ分布し、旧大陸には生息しない）東洋では歴史的にコウモリを嫌忌する伝統はない。むしろ、中国語で「蝙蝠」 () の音が「福が偏り来る」を意味する「偏福」 () に通じるため、幸運の象徴とされている。またキューバの絶滅した先住民タイノス（タイノ族）族はコウモリが健康、富、家族の団結などをもたらすと信じており、同地で創業した世界的ラム酒「バカルディ」のロゴマークに採用されている。
日本では蚊食鳥（カクイドリ）とも呼ばれ、かわほりの呼称とともに夏の季語である。蚊を食すため、その排泄物には難消化物の蚊の目玉が多く含まれており、それを使った料理が中国に存在するとされる。
「強者がいない場所でのみ幅を利かせる凡愚」の意で、「鳥無き里の蝙蝠」という諺がある。また、織田信長はこれをもじって、四国を統一した土佐の戦国大名である長宗我部元親を「鳥無き島の蝙蝠」と呼んだ。この「鳥無き島（里）の蝙蝠」という表現は、古くは『夫木和歌抄』巻第二十七に平安末期の歌人和泉式部の歌に「人も無く鳥も無からん島にてはこのカハホリ（蝙蝠）も君をたづねん」鈴木棠三・広田栄太郎『故事ことわざ辞典』（東京堂出版、36版1968年）p.687.とあり、鎌倉期の『沙石集』巻六にも「鳥無き島のカハホリにて」とあるコトバンク。ことから、少なくとも12世紀には記されていたものとわかる。
沖縄の八重山人は蝙蝠の子孫を称していた。この他、琉球諸島の各島々の伝説では、人間以外の生物に起源を求めるものが多く、蝙蝠起源はその内の一つである。島民は自らの先祖である動物を敬い、大切にしたが、各島民が互いに悪口をいう際は、「○○の子孫が」といった風になったという。
コウモリは分類学上は哺乳類であるが、鳥と同様に翼を持ち飛行することが可能である。これを参考にしたイソップ寓話『鳥と獣とコウモリ』がある。獣と鳥が争う中、コウモリはどっちにもいい顔をし、結果どちらからも嫌われてしまう童話であり、現在でもどっちつかずな人、日和見主義者をののしる表現として「コウモリ」を使用することがある。