San Rafael er en by og administrasjonssentrum i kantonen Guatuso i provinsen Alajuela i Costa Rica. Distriktet San Rafael har et areal på 304,1 km² og et innbyggertall på 7 1941 (2003). Den fikk bystatus 4. mai 1970.
Byen har butikker, banker, en bensinstasjon, medisinsk klinikk, apotek, noen få restauranter og overnattingsmuligheter.
Kategori:Byer i Costa Rica Kategori:Costa Ricas distrikter