リンゴ（林檎、学名: ）は、バラ科リンゴ属の落葉高木の一種、またはその果実（図1）のこと。作物群としては花托が肥大した部分を食用とする仁果類（仁果果実）に分類される果樹（果実）である。植物学上の和名では、セイヨウリンゴともよばれる。
中央アジア原産であると言われているが、紀元前から栽培されるようになり、他種との交雑を経てヨーロッパで確立し、現在では世界中の主に温帯域で栽培されている（→#起源と歴史）。2022年時点での世界におけるリンゴ生産量は約9,600万トンであり、国別では中国が約半分を占めている（→#生産）。日本では遅くとも鎌倉時代以降に中国原産の同属別種であるワリンゴ（）が栽培され、「リンゴ」とよばれていたが、明治時代にセイヨウリンゴが導入され、一般化するに伴ってセイヨウリンゴが「リンゴ」とよばれるようになった（→#名称）。2023年時点では、日本でのリンゴ生産量は約60万トンであり、青森県が約62.8%を占めている。
秋に落葉し冬に休眠するが、一定の低温を経ることで覚醒して春に萌芽・開花する（→#形態的特徴、→#生理的特徴）。花は白から薄紅色、自家不和合性を示し、同一品種の間では結実しないため、遺伝子型が異なる他品種の花粉を受粉する必要がある。秋にほぼ球形で上下が窪んだ大きな果実が実る。普通熟すと果実の表皮にアントシアニンが蓄積して赤くなるが、黄色や黄緑色の品種もあり、特に緑色が強いものは「青リンゴ」ともよばれる。雌しべを包む花托が発達して果肉となり、一般的に歯応えがよく、甘味と酸味がある。
栽培する際には、接ぎ木によって植栽するため、同一の品種は遺伝的に同一のクローンである（→#栽培）。近年では、樹を矮化（わい化）させて栽培することが多い。商品価値のある果実を多数収穫するためには、整枝剪定、病虫害防除、花や果実の間引き、ときに果実の袋かけや回転などさまざまな作業を必要とする。果実の貯蔵性は品種によって異なるが、CA貯蔵など貯蔵技術の進歩によって、早生品種収穫まで前年の晩生品種が出荷されてリンゴは周年供給されている。極めて多数の品種（正確には栽培品種）が作出されており、‘ふじ’、‘つがる’、‘王林’、‘ジョナゴールド’、‘レッドデリシャス’、‘ゴールデンデリシャス’、‘ガラ’、‘グラニースミス’などがある（→#品種）。
果実はふつう生食されるが、アップルパイなど調理用とされたり、ジュースやシードル、ジャムなどに加工されることもある（→#利用）。エデンの園やギリシア神話などリンゴは文化や芸術においても古くから人と関わってきた（→#文化）。またビートルズやAppleなど、現代でもシンボルとされることがある。
名称 和名 「林檎」は、もともと中国北部原産のワリンゴ（; 図2）を示す中国名であった。中国では、「林檎」は遅くとも6世紀の本草書に記されており、この名は、果実を食べに鳥が集まることを示す「来禽」に由来するともされる。日本における「林檎」の初出は、深江輔仁が918年に著した薬草に関する書籍、「本草和名」である。平安時代中頃の『和名類聚抄』では、「林檎」に対して「利宇古宇（リウコウ/リウゴウ/リンゴウ）」の読みを記している。江戸時代の『本朝食鑑』によれば、大抵林檎は縄で縛ったような溝があり、そのような形の物を俗に「利宇古(りうご)」と呼んでいたという。中世以降はリンキ、リンキン、リンゴの読みも見られるようになり、近世になるとリンゴの読みが一般的となった。
thumb|center|200px|2. ワリンゴの果実
日本において、この「リンゴ」（現在のワリンゴ）は、遅くとも鎌倉時代以降に小規模栽培されていたが、江戸時代になるとある程度一般化していた。1787年（天明7年）には、後桜町上皇が人々に3万個のリンゴを配ったとする記録がある。しかし、明治時代に欧米から が導入され、これが栽培されるようになり、急速に一般化していった。この は、当初は従来のリンゴ（ワリンゴ）と区別してオオリンゴ（大林檎）やセイヨウリンゴ（西洋林檎）、トウリンゴともよばれていたが、やがてこの植物がリンゴとよばれるようになった。これに対して従来のリンゴの栽培は激減し、ワリンゴ（和林檎）またはジリンゴ（地林檎）とよばれるようになった。
中国において、セイヨウリンゴは「」、「」、「」と表記され、日本でも明治から昭和前半にかけて「苹果（へいか）」と表記・呼称されることがあった。青森県りんご試験場（現 りんご研究所）は、1950年までは青森県苹果試験場とよばれていた。
学名 セイヨウリンゴの学名は歴史的に長く混乱し、、、、 などの名が用いられていた。Quian et al. (2010) によって、非合法名であった を保存名とすることが提唱され、2017年の第19回国際植物学会大会で承認された。2024年現在では、セイヨウリンゴに対してこの学名を用いることが多い。種小名の "domestica" は、ラテン語で「栽培化された」などを意味する。
カラナシ リンゴを表す古語に「カラナシ」がある。平安時代の『新撰字鏡』や『和名抄』には赤林檎（セイヨウリンゴ）を表す「柰」という字に「奈以(ない)」、「加良奈志(からなし)」という読みが記されている。からなしという読みは「唐から渡来した梨」と意訳したものだと考えられている。1697年の『本朝食鑑』には、昔は柰を「からなし」と読んだが近世は「ふなえ」と読むと記述されている。1709年の「大和本草」では、柰に「リンキン」の読みをあて、ワリンゴを指すものとされており、名称の混乱が見られる。
起源と歴史 thumb|center|500px|3. リンゴの起源と伝播: 天山山脈（濃緑部）の西側に分布する が西に運ばれて栽培化され、ヨーロッパにおいて と交雑して現在のセイヨウリンゴ（）が成立した。また東へ運ばれた （点線）はシベリアリンゴ () と交雑してワリンゴ () を生み出した。
thumb|right|200px|4. セイヨウリンゴの祖先種である の果実 現在栽培されているリンゴ（セイヨウリンゴ）は、中央アジアに起源をもつと古くから考えられていた。リンゴや近縁種のゲノムの比較からは、リンゴは中央アジアに分布する （図3, 4）に由来することが示されている。 のうち、天山山脈の西側に分布している集団がセイヨウリンゴの起源と考えられており、東側の新疆に分布する集団は関わっていない（上図3）。この付近にあるカザフスタン最大の都市であるアルマトイは、現地語で「リンゴの里」を意味する。この が栽培化されてシルクロードを通って西へ運ばれ、いくつかの種と交雑したが、特にヨーロッパで と交雑することで大きな影響を受け、現在のセイヨウリンゴ（）が成立したと考えられている（上図3）。また逆に、セイヨウリンゴから への広範な遺伝子流動も起こっていることが報告されている。起源種である は柔らかい果肉をもつが、栽培化の過程で果肉が程よく硬いものが選択されてきた。果実の硬さは、食味だけではなく輸送性・保存性の向上にも重要である。また、より甘味が強いもの、酸味が弱いものが選択されてきたことが示されている。祖先種である はもともと野生リンゴの中で最も大きな果実を形成する種であるが、栽培の過程でより大きな果実へと進化する緩やかな選択圧があったことが示唆されている。炭化した"リンゴ"の遺物は約8,000年前のアナトリアの遺跡から見つかっており、また約4,000年前のスイスの遺跡からは大小2種類の"リンゴ"の遺物が報告されている。
ペルシア帝国では果樹園がつくられ、リンゴは贅沢品として扱われ、最高のものはジョージア（グルジア）産とされていた。ギリシア時代には、テオプラストス（紀元前3–4世紀）がリンゴの野生種と栽培種を区別しており、栽培法や接ぎ木について記している。ローマ時代にもリンゴは贅沢品として果樹園で栽培され、大プリニウス（紀元1世紀）はリンゴに23品種があることを記している。典型的なローマ人の食事は卵料理で始まり果物で終わったことから、ラテン語の「卵からリンゴまで (ab ovo usque ad mala)」が「最初から最後まで」を意味していた。また、カエサル（紀元前1世紀）はブリタニアに侵攻した際に、原住民が野生リンゴを発酵させてシードルを醸造していることを見つけ、これをローマに持ち込んだ。ローマ帝国の拡大に伴って、リンゴ栽培はスペイン、フランス、ブリタニアに広がり、フランス南東部に残るモザイク画には、リンゴの接ぎ木から収穫までが描かれている。中世になるとヨーロッパではリンゴ栽培は一時的に衰退したが、修道会などでリンゴの栽培が続けられた。カール大帝（8–9世紀）は、御領地令においてさまざまな植物とともにリンゴを植えることを命じており、その中には甘いもの、酸味があるもの、貯蔵性が良いもの、早生などさまざまな品種を記している。やがて13世紀になるとリンゴ栽培は再び盛んになり、現在まで続く品種が現れるとともに、徐々に一般的なものになっていった。また、16世紀に生まれたプロテスタントはリンゴを好み、プロテスタントの広がりはリンゴ栽培を広げた。リンゴの品種改良も進み、17世紀には少なくとも120品種が記録されている。16–17世紀以降には、ヨーロッパ諸国の海外進出に伴って、リンゴは南アフリカ、北米、南米、オーストラリアなどに広がっていった。北米東海岸では雨が多い気候のためヨーロッパから持ち込んだ多くの品種は接ぎ木などでは育たず、播種されて実生から育てたものが増えていき（リンゴの種子からは、親品種とは異なるさまざまな特徴をもつ子孫が生まれる）、その中には現在でも利用されている優れた品種が多く含まれている。
セイヨウリンゴの基となった は東へも運ばれ、シベリアリンゴ () と交雑してワリンゴ () やイヌリンゴ () が生まれたと考えられている（上図3）。ワリンゴは中国で古くから栽培され、多数の品種も作出されていた。しかし、19世紀半ばになると中国にもセイヨウリンゴが導入され、商業的に生産されるリンゴのほとんどがセイヨウリンゴとなった。中国におけるリンゴ（セイヨウリンゴ）生産は1980年代以降に増加し、2022年時点では世界総生産の約半分を占めるに至っている。
日本では、遅くとも鎌倉時代ごろに中国から導入したワリンゴが栽培され、リンゴ（林檎）とよばれていた。しかし、江戸時代末ごろから、日本にもセイヨウリンゴか持ち込まれるようになった。1854年（安政元年）に、米国からもたらされた「アッフル」が加賀藩下屋敷（板橋宿）にて栽培され、翌年に実をつけたために食用とされたことが、当時の加賀藩士の記録藩主近習の小川仙之助『御参勤御供中日記』に残っている。藩主（前田斉泰）から「小さな餅に塗って食べるように」と言われて近習らはそのようにしていることから、ジャムにして食したものと考えられている『広報いたばし』2009年3月21日。文久年間（1861–1863年）には、福井藩主で幕府政事総裁職であった松平春嶽が米国産のセイヨウリンゴの苗木を入手し、それが江戸郊外巣鴨の福井藩下屋敷にて栽培されていたともされる。また、明治初年に北海道函館に入ったドイツ人のR・ゲルトナー（ガルトネル）がもたらしたともされる。
1871年（明治4年）、北海道開拓使の次官であった黒田清隆は、米国から多数の果樹の苗木を持って帰国した。この中には、‘国光’（原名: ‘Ralls Janet’）、‘紅玉’（‘Jonathan’）、‘柳玉’（‘Smiths Cider’）、‘倭錦’（‘Ben Davis’）、‘紅魁’（‘Red Astrachan’）などリンゴの75品種が含まれており、これらは東京青山の官園などで育成され、北海道にも送付された。1874年（明治7年）以降は、内務省がリンゴ苗木を全国に配布した。1875年（明治8年）には、前田正名がフランスから108品種を導入したが、多くは日本の雨の多い環境には合わなかった。このように日本におけるセイヨウリンゴの商業栽培が始まり、急速に一般化していき、ワリンゴに代わってセイヨウリンゴがリンゴ（林檎）とよばれるようになった（上記参照）。
形態的特徴 落葉小高木から高木であり、高さ2–15メートル (m)、幹の直径5–30センチメートル (cm) になる（下図5a）。一般的に、主幹、主枝、亜主枝、側枝からなる。栽培下では、作業を容易にするために樹高を低く仕立てられることが多い。樹皮は暗灰色から灰褐色、古くなると不規則に剥がれる（下図5b）。一年枝は暗褐色から赤褐色、密に軟毛があるが、やがて無毛になる（下図5c）。小枝には、白い皮目が目立つ（下図5c）。冬芽は卵形から円錐形、長さ3–4(–5)ミリメートル (mm)、暗赤色から紫色の芽鱗で覆われ、軟毛が密生し、枝先の頂芽は側芽より大きい。葉痕はV字形、維管束痕が3個つく。葉の芽中姿勢は片巻き状。
葉は単葉、長枝に互生し、また短枝に束生する。托葉は早落性、披針形で先端はとがり、長さ 3–5 mm（下図6a）。葉柄は長さ 10–35 mm、白い毛が密生または散生（下図6）。葉身は厚くシワが目立ち、楕円形から卵形、(2–)5–13 × (1–)3–6.5 cm、最大幅は基部側から中央付近、葉縁に鈍い鋸歯または不整の重鋸歯があり、基部は広楔形から円形、先端は鋭頭または鈍頭、表面（向軸面）は濃緑色で初めは白い綿毛があるがのちに無毛、裏面（背軸面）は緑白色で軟毛が密にある（下図6a, b）。秋になるとふつう黄葉して落葉する（下図6c）。
北半球では花期は4月から5月、ふつう短枝の先端、ときに葉腋に花序（花叢ともよばれる）をつける。花序は、花序軸に相当する果台、そこから散形状に生じる中心花と2–7個の側花、花序軸についた数枚の葉（果台葉）からなり（下図7a）、またときに果台葉の葉腋から枝（果台枝、副梢）が出る。つぼみは紅色、葉の展開と同時または少し遅れて開花する（下図7a, b）。小苞は早落性、糸状、長さ 5–7 mm。花柄は長さ 10–25 mm、軟毛が密生する（下図7a, b）。花は直径 30–40 mm、花托に綿毛がある（下図7b, c）。萼片は5個、開花時に反り返り、披針状三角形から卵状三角形、長さ 6–8 mm で花托（萼筒）長と同程度かそれより長く、先端は尖鋭形、表面に綿毛が密生する（下図7b, c）。花弁は白から淡紅色、5個、倒卵形、長さ 15–25 mm、爪長 1 mm、縁は全縁、先は丸い（下図7c）。雄しべは約20個、長さ 9–10 mm、裂開する前の葯は黄色（下図7c）。柱頭は緑色、花柱はふつう5個、長さ 9–10 mm、雄しべよりわずかに長く、灰色の腺毛が密生、長さの半分以下基部側で合生し、子房は花托に包まれ下位、5室で中軸胎座、各室は2個の胚珠を含む（下図7c）。
果期は品種により異なるが、北半球では7月から11月。幼果のときには表面は有毛（下図8a）、気孔が機能して光合成も行うが、やがて脱毛して気孔の痕はコルク化して果点となる。果実はナシ状果（いわゆる"芯"の部分（果心）が子房に由来する真の果実におおよそ相当し、それを囲む花托（花床とも）に由来する部分が可食部になる; 仁果ともよばれる）であり（下図8c, d）、成熟すると球形から扁球形や円錐形、直径 20-120 mm、皮にはふつうアントシアニンが蓄積して赤色でときに縞状や斑点状に着色するが（下図8b）、品種によっては緑色から黄色になり、また表面はロウ質または粉を吹いたようになる。‘ジョナゴールド’など一部の栽培品種では、果実がリノール酸やオレイン酸など不飽和脂肪酸を分泌し、果皮のロウ質物質が溶けて脂ぎってベト付くようになることがあり、「油あがり」とよばれる。また皮の一部がコルク化してざらついた褐色になることがあり、「さび」または「しぶ」とよばれる。果実の上下が窪んでおり、果柄（つる、梗）がつながるくぼみは「こうあ部（梗窪部、つる元）」、その反対側の萼が残っているくぼみは「がくあ部（萼窪部、ていあ部（蒂窪部）、花止まり）」とよばれる（下図8c）。果肉（子房を包む花托に由来する）は石細胞を欠き、ふつう黄白色から黄色であるが（下図8c, d）、アントシアニンを含んでピンク色から赤色を呈する品種も存在する。
完全に受精が起こると、果実中には10個以上の種子が形成され、種子は淡褐色、長さ約 8 mm（上図8c, 下図25）。受粉・受精が不完全であると種子数が少なくなり、果実の形が崩れたものになる。染色体数は 2n = 34、ときに51（三倍体）または68（四倍体）。
生理的特徴 リンゴは日当たりを好む陽樹である。冷涼な温帯域を好むが、一部の品種は亜熱帯から熱帯域で栽培可能である。肥沃で適湿、砂質、ローム質、または粘土質の土壌を好む。リンゴは、ふつう下記のように芽の自発休眠打破のために一定の低温を必要とし、またそれ以外の季節では極端な低温がないことで生育可能であり、これらを満たせば南北緯度30°から50°の広範な地域で栽培可能である。ただし、一般的に果実成熟期の気温が25°C以上になると、果実の着色不良や果肉の軟化などの問題が生じる。ほとんどのリンゴは栽培下にあるが、野生化したものもあり、鳥や哺乳類が散布した種子や、人が廃棄したリンゴに由来する。このような野生化したリンゴは、苦味・酸味がある小さな果実をつけることが多い。
成長 thumb|right|200px|9. リンゴの実生 種子から発芽した実生（図9）は、ふつう数年間は花芽をつけずに栄養成長を行う幼若期にある。その後、花をつけて着果する成木期に移行し、場合によっては100年以上も着果する。ただし、栽培下ではふつう成木期にある穂木を接ぎ木して栽培するため、通常は1–2年で花芽をつける。
リンゴは単軸成長を行い、新梢は茎頂に花芽を分化させるまで葉を分化し続ける。新梢の伸長はふつう7–8月に停止するが、再び頂芽が伸長することもある（二次成長とよばれる）。一般的に、新梢の長さが樹勢の強弱を示す指標となる。新梢の伸長期間や長さは、品種特性、台木特性、植物ホルモン、栄養状態、光条件、温度、土壌などさまざまな要因が関係し、また栽培下では整枝剪定、施肥などの栽培管理による影響も大きい。新梢成長の初期には貯蔵養分を利用しているが、やがて葉の光合成でつくられた光合成産物と根で吸収した無機養分を利用した成長に移行する。
thumb|right|200px|10. リンゴの樹 新梢の成長は頂部優勢を示し、ふつうは枝の上部にある頂芽や腋芽から伸びた枝が長く成長し、下部の芽に由来する枝は短いかほとんど成長しない。このような成長の繰り返しによって樹形が形成されるため、無剪定では側枝が発達して開心形のような樹形になる（図10）。ただし、品種の中には新梢があまり成長しないものもある（カラムナータイプなど）。
リンゴの葉の光合成速度は、600–1,200 µE/m2/s の光強度で 12–19 µmol/m2/s である。光合成速度は朝から徐々に高くなり、昼頃から温度や水分ストレスによって徐々に低下する。純同化率は最大で 5 g/m2/day であり、果実収量では約 12 t/10a になるが、さまざまな生理的・環境的要因の影響を受けるため、生産量を高めるためには葉面積指数や光環境を最適化する必要がある。
休眠 thumb|right|200px|11. 雪中のリンゴ リンゴは落葉樹であり、秋に落葉して休眠状態に入り、耐寒性が増加して越冬する（図11）。日本では、芽は9月頃に自発休眠期に入り、11月初旬に最も深く休眠する。その後の低温の蓄積によって、自発休眠は打破される。自発休眠打破に必要な低温は、温度によって異なる値（0°Cで0.3、7.2°Cで1、15°Cで0、それ以上で負の値など）の積算値（チルドユニット）によって求められ、日本で栽培される多くの品種では800–1,200チルドユニット（おおよそ4–7°Cで1,000–1,200時間）である。これによって芽の自発休眠は打破されるが、ふつう外気温がまだ低温であるため成長は抑制され、他発休眠の状態にある。その後、3月頃の気温上昇に伴って芽は成長を開始し、4月頃に萌芽・開花する。
休眠中のリンゴは耐寒性が高く、-35°Cにも耐えられるが、その前後では耐寒性が低く、異常気象によって低温障害が生じることがある。また、台木のうち矮性台木の耐凍性は低く、-10°C程度のことがある。
花 thumb|right|200px|12. リンゴに訪花したセイヨウミツバチ リンゴの花芽（花と葉を生ずるため混芽である）は、枝の成長が停止する初夏から夏にかけて分化を開始し、夏から秋にかけて発達して冬が来る前にほぼ完成する。このように花芽は新梢の伸長停止後に分化を開始するため、栄養成長が早く停止したものほど花芽分化が早く始まり、栄養成長が遅くまで続くと花芽の分化が遅くなる。
花芽は、冬季の低温による自発休眠の打破の後（上記参照）、春になって暖かくなる（4.5°C以上の積算値によることが知られている）と開花する（図12）。1つの花叢（花序）の中では中心花が最初に開花し、のちに側花が開花する（上図7a）。また1本の枝の中では頂芽が先に開花し、腋芽が後で開花する。多数の果実がつくと、養分の競合や果実内の種子が生産するジベレリンによって翌年に開花する花芽の分化が抑制されるため、隔年結果の原因となる。そのため、栽培の際には早めの摘蕾・摘花・摘果が重要となる。また、リンゴの花芽分化は光環境に影響されやすいため、整枝・剪定によって結果枝の光環境を保持する必要がある。
+表1. リンゴ主要品種のS遺伝子型 S遺伝子型 品種S1S2 ‘国光’、‘こうこう’、‘Parker's Pippin’S1S2S3 ‘Kanada R’、‘Spigold’S1S3 ‘シナノゴールド’、‘新世界’、‘秋映’、‘ぐんま名月’S1S3S9 ‘ハックナイン’S1S5 ‘White Transparent’S1S6 ‘甘錦’S1S7 ‘きおう’、‘シナノスイート’、‘千秋’、‘いわかみ’S1S7S9 ‘北斗’S1S9 ‘ふじ’、‘アルプス乙女’、‘Spencer Seedle’S1S9S21 ‘Ribston Pippin’S1S10S15 ‘Kaiserapfel’S1S20 ‘祝’S1S25 ‘Milton’S1S28 ‘星の金貨’S2S3 ‘ゴールデンデリシャス’、‘きざし’、‘紅はづき’S2S3S5 ‘ベルドゥボスクープ’S2S3S9 ‘ジョナゴールド’S2S3S20 ‘陸奥’、‘静香’S2S4 ‘Champagne’、‘Reinette’S2S5 ‘ガラ’、‘Greensleeves’、‘Falstaff’S2S7 ‘王林’、‘東光’、‘Arlet’、‘クリップスレッド’S2S7S24 ‘あおり9 (彩香)’S2S9 ‘トキ’、‘金星’、‘はるか’、‘春明21’、‘アキタゴールド’S2S10 ‘Prima’、‘Spencer’S2S22 ‘Delbard Jobile’S2S23 ‘クリップスピンク (ピンクレディ)’S2S24 ‘ハニークリスプ’、‘サイフレッシュ (ジャズ)’S2S25 ‘Trajan’、‘Summerland’S2S28 ‘王鈴’、‘カメオ’、‘Goldrush’S3S5 ‘エルスター’、‘Fiesta’、‘Rubinette’、‘Shinsei’S3S6 ‘Oberrieder’S3S7 ‘つがる’、‘アイダレッド’、‘紅月’、‘あかぎ’S3S7S8 ‘Stafnel Rosen’S3S9 ‘世界一’、‘夏緑’、‘陽光’、‘はつあき’、‘あいかの香り’S3S10 ‘シナノレッド’、‘Ahrista’、‘Ecolette’、‘Telamon’S3S20 ‘Meku 10’S3S22 ‘Merlijn’S3S23 ‘グラニースミス’S3S25 ‘Macoun’、‘Victory’S3S28 ‘Ging Gold’、‘Korei’S5S7 ‘さんさ’、‘Vanda’S5S7S9 ‘Karmijn S’S5S7S10 ‘Brünn’S5S8 ‘J Greve’S5S9 ‘コックスオレンジピピン’、‘サイレート (エンヴィ)’S5S20 ‘James Grieve’S5S23 ‘ベンデイヴィス’S7S9 ‘紅玉’、‘千雪’、‘ひめかみ’S7S20 ‘印度’、‘北の幸’S7S23 ‘レディウィリアムズ’S7S24 ‘あかね’、‘Jonamac’S7S28 ‘Rero II’S8S9 ‘Wellington’S8S32 ‘アントノフカ’S9S10 ‘スパルタン’S9S24 ‘ブレイバーン’S9S25 ‘きたかみ’S9S28 ‘レッドデリシャス’、‘メルローズ’、‘恋空’、‘Jonadel’S10S16 ‘メイポール’S10S22 ‘ロボ’S10S24 ‘Discovery’、‘Vista Bella’S10S25 ‘マッキントッシュ (旭)’S10S28 ‘エンパイア’S20S24 ‘ロームビューティ’S24S25 ‘Tydeman's Early’、‘Worcester’、‘東北2号’ リンゴは虫媒花であり、日本では小型ハナバチ類、ハナアブ類、マメコバチ、ミツバチが主に訪花する（図12）。リンゴ園ではセイヨウミツバチやマメコバチを導入していることが多く、また人工授粉を行うこともある。雌しべの受精能は開花直後から2日程度であり、その後は急速に低下する。リンゴは自家不和合性（自らの花粉や同一品種の他個体間では受精できない性質）をもち、異なる品種間でも不和合性を示すことがある。この不和合性はS遺伝子によって支配されている（表1）。S遺伝子には多数の型が知られているが、雌しべにおいて発現しているS遺伝子（複相であるためふつう2遺伝子型）の一方と花粉で発現しているS遺伝子（単相であるため1遺伝子型）が一致すると、リボヌクレアーゼが合成されて花粉管の伸長が阻害され、受精が成立しない。ただしこの不和合性は必ずしも完全ではなく、全く結実しないものもあるが、多くの品種において自家結実率は0％ではなく、また例外的に‘恵’は60%ほどの自家結実率を示すことが報告されている。この結実は、自家和合性と単為結果性の両方に起因すると考えられている。‘恵’は、授粉樹として、また自家結実性品種作出のための素材として注目されている。また、‘ジョナゴールド’や‘陸奥’など三倍体の品種では、花粉が基本的に不稔である。
果実 受精した果実は肥大を開始し（下図13）、開花後1ヶ月ほどは細胞分裂を続けて細胞数が増加するが（この際には植物ホルモンであるサイトカイニンが多い）、その後は細胞の肥大によって果実が肥大する。そのため、開花後の摘花・摘果が遅れると果実間の養分競合によって細胞数が少ない幼果になってしまい、成長した果実も小さくなる。また果実基部の果柄を取り囲む部分が隆起して窪み（こうあ部）を形成し、また果実頂部の萼を取り囲む部分も隆起して窪み（がくあ部）を形成する。果実の肥大に利用される養分は、初期には樹体に貯蔵されたものが使われるが、やがて枝葉が発達するに従って葉からの光合成産物と根からの水・無機養分が利用される。果実は初めに縦方向に伸長し、その後に横方向に肥大するため、早く寒くなる地域では果実の縦横比が大きくなる。
thumb|center|200px|13. 幼果の縦断面
受精しなかった果実は開花後2–4週間で落果する。また発育を始めた果実でも、受精後4–6週間で落果することがあり、早期落果（ジューンドロップ June drop）とよばれる。早期落果の原因は、養分や植物ホルモンの不足であり、果実中の種子（植物ホルモンを生成）が少なかったり、栄養成長が過多で果実への養分供給が不足した場合に起こりやすい。早期落果の起こりやすさは品種によって異なる。